高新技术企业认定证书三年有效期届满后，并不会自动续期，企业需要主动在有效期到期之前，重新准备申报材料，按照当年现行有效的高新技术企业认定管理办法，向认定机构提出复审（重新认定）申请，复审的条件和申报材料要求，跟首次认定基本一致，都需要满足研发费用占比、科技人员占比、高新技术产品收入占比等核心指标。

需要提醒的是，复审不是形式审查，而是按照最新的认定标准重新进行实质性评审，企业不能认为上次通过了这次肯定也能过，如果企业在三年有效期内的研发投入强度、科技人员配置、高新技术产品收入占比等指标出现下滑，不再满足认定标准，复审同样可能不通过，导致企业失去高新技术企业资格。

如果企业未能在证书有效期届满前及时提出复审申请，或者复审未通过，企业将自证书有效期届满之日起不再具备高新技术企业资格，需要按照普通企业的税率计缴企业所得税，此前依据高新技术企业身份享受的15%优惠税率等税收优惠随之终止，如果企业期望在未来重新获得资格，需要按照首次认定的流程重新申报。

建议企业建立高新技术企业资格的到期提醒机制，提前一年左右就开始着手准备复审材料，持续关注自身研发投入、人员配置、收入结构等核心指标是否维持在认定标准之上，而不是等到证书临近到期才仓促应对，避免因为资格中断导致税收优惠享受出现断档。