刷单本质上是电商经营者为了提升店铺销量、好评数据等营销指标，通过虚构交易、组织虚假下单等方式伪造真实交易的行为，从税务角度看，如果刷单交易被计入了企业的销售收入、并据此开具了发票，这部分不具有真实交易背景的收入和发票，存在被税务机关认定为虚构交易、虚开发票的风险。

税务稽查如果发现企业存在刷单导致的收入虚增问题，处理方式通常包括：核实实际真实的收入规模，对虚增部分对应多缴或者少缴的税款进行调整（刷单可能导致销项税额虚增但对应没有真实进项支撑，也可能被用于虚假冲抵成本套取其他税收利益，具体处理需结合实际情况判定）；如果认定构成虚开发票，企业和相关责任人可能面临行政处罚，情节严重、金额较大的，可能被移送公安机关追究刑事责任。

除了税务层面的风险，刷单行为本身在电子商务法和反不正当竞争法层面也是被明确禁止的违规行为，电商平台一旦发现商家刷单，通常会依据平台规则给予降权、扣分、清退等处罚，市场监管部门也可能依据反不正当竞争相关规定对刷单行为进行行政处罚，刷单是一个在多个监管维度都存在风险的行为，不只是税务一个层面的问题。

建议电商企业摒弃刷单这种短视的营销手段，通过真实的产品和服务质量提升店铺经营数据，如果企业历史上确实存在刷单导致账务和申报数据异常的情况，建议尽早自查并咨询专业财税和法律顾问，评估风险敞口，必要时通过合规的方式主动更正申报数据，降低被税务机关稽查发现后从重处理的风险。